日本占领台湾期间，为消弭岛上汉人的民族意识，曾以废除「淫祠」为名，想要废除具有浓厚民族色彩的道教庙宇，因而有不少道庙在後殿供奉佛教的观世音，假托佛教寺庙而得予保存;有的则请和尚为住持，以减少日本人之纠葛。日本.宫本延人《日本统治时代台湾地区寺庙整理问题》(天理教道友社，一九八八年出版)、一八九九年七月台湾总督府令第五九号《旧惯社寺庙宇等建立废合手续》，以及日本昭和十六年至昭和二十年间，在台发行的《民俗台湾》(东都书籍刊印)中所见在台学者之讨论皇民化及民俗问题等，都可以看出日本政府，借行政以干涉宗教之一斑;也加深了道教被佛教所矮化，造成佛高於道的错觉。

　　妈祖的神格属性，由妈祖庙的称号、庙貌、神像、供祭物、科仪、平安符、祭神活动(刈香、绕境)等看来，全属道庙规制而非佛教。再由妈祖成道前的修行法门、显圣济民等等看来，妈祖也完全合於道教以修链和济民为主的修行方式。而妈祖的封号由「夫人」而「妃」而「天妃」而「天后」等，这些皆是道教神只封号。加赠封号，有一定的规则，先卑後尊，於是由女神，进而夫人，进而封妃，进而天妃，进而天后等;封号也由二字而增至三十字。我们以宗教本身的规范来检视妈祖，可以确定妈祖是道教神只。

　　在台湾，妈祖会被有心人士操弄成佛教神只，主要原因大概有下述几项：其一是，明後的传记，将妈祖和观音牵连上关系，一般人不去细究此观音是道教化的观音，已非佛教观音，只凭直觉将观音和佛教划上等号。其次是，台湾北港妈祖神像是清康熙三十三年，树璧和尚自福建湄洲天后宫奉请来北港，并建庙为第一任住持。树璧和尚属佛教临济宗，福建临济宗的和尚，大都和民间斋教有密切关系，偏向三教合一，并非「正统」佛教徒。树璧来台时，可能是带妈祖以保平安，到台後感念妈祖保佑，所以树璧和尚才会奉祀妈祖，为之立庙。其三是，从事田野调查者常以庙祝所说为真，无力考证经典，而庙祝并非鸿儒硕学，学识有限，难免误说，再看到和尚为庙祝，於是以为妈祖出於佛教。

　　综上所说，妈祖的被视为佛教徒或佛教属神，实是出自台湾地区的特殊现象。但此种现象，借由台湾佛教的发展，逐渐影响到东南亚。笔者今年(二00七年)八月到马来西亚讲学时，友人告知吉隆坡天后宫信徒中，也出现了妈祖属性归佛归道之争。

　　其实妈祖是有师父的，祂的师父是“老道士玄通”，学的是“玄微秘法”，玄微秘法并不是佛教的任何门法，妈祖在佛教不是什么菩萨更不是什么佛，祂是一个广济世人的女神，因此是道非佛是不争之论，此理至明。

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